1、仪器使用的广泛程度  

如果不是一个新出现的仪器品牌
，为保证所购置的仪器有充分的可靠性
，临床PCR实验室可以从相应仪器在国内外使用的广泛程度来判断。应用越是广泛的仪器
，越是经过实践验证的
，也就越具有可靠性。

2、仪器的检测通量（反应孔数）  

在购买定量PCR仪的时候需要根据实验室的要求来选择不同通量的仪器。目前市面上的荧光定量PCR仪的检测通量小到16多到384孔
，实验室可以根据自己的检测项目和发展状况
，选择合适的仪器
，没必要追求最昂贵的仪器
，一般来说
，96孔的通量足够用了；如需寻找新药靶点和疾病标记等类型的实验
，则可以考虑购买384孔的仪器。

3、仪器的通道数量  

随着医院开展的项目越来越多
，比如基因表达
，单核苷酸多态性分析、高分辨率熔解曲线等
，那么单通道的仪器则无法满足实验室的需求了
，而多通道的设计则能使其更方便地检测多重PCR检测及其衍生的基因表达等其他分析模式。

4、耗材的开放性  

耗材如扩增反应管的开放性可能会决定日常检测成本的高低。作为临床PCR实验室
，在选择实时荧光PCR仪时
，可考虑这一点。不过对于检测HCV等RNA项目的时候
，尽量使用去RNAnase酶耗材。

5、硬件设计特点  

荧光定量PCR仪主要有96孔板式和离心式等
，每种设计都有它的独到之处
，但也都有无法避免的缺陷。  

96孔板的荧光定量PCR仪可以容纳的样本量大
，最大可至100ul
，而且无需特殊的耗材。传统的96孔板仪器多采用卤钨灯激发、CCD检测。其优点在于：卤钨灯的光强比LED灯强
，波长范围广
，对于荧光染料的激发具有非常好的效果
，性能比较稳定
，使用寿命约3000个小时左右；但CCD的检测通；嵋蛭扛鲅房拙喙庠春图觳馄鞯墓獬谈鞑幌嗤
，会产生边缘效应
，对结果产生一定的影响。为了保证精确、精准的实验结果
，这类仪器在实验过程中通常需要配合ROX校正染料
，来平衡孔间差异；离心式的仪器通常选用LED激发、PMT检测
，设计上避免了边缘效应
，同时PMT检测对荧光信号可以放大或缩小
，相对于CCD检测更加灵活
，灵敏度更高；但LED的荧光强度比较弱
，波长范围也比较窄
，因此
，对荧光染料的激发效果不如卤钨灯；

6、运行速度  

在荧光定量PCR仪的众多技术参数中
，升降温速度也是非常重要的。更快的升降温
，可以缩短反应进行的时间
，而且缩短了可能的非特异性结合和反应时间
，提高PCR的特异性。但是
，运行速度越快
，对加热制冷？榈囊笤礁
，因此
，稳定性是其存在的最大问题
，如果在市面上经过长期考证的
，稳定性好的仪器
，运行速度越快
，带来的便捷越多；

7、灵活性  

在仪器基本性能得到保证的情况下
，另外一方面则需要考虑仪器的灵活性
，主要包括：仪器运输的灵活性
，拆卸的灵活性
，软件升级的灵活性
，？楦坏牧榛钚砸约笆褂玫牧榛钚缘。